Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTRLP40313 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTRLP40313 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTRLP40313 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRLP40313 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRLP40313 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms