Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PPFIA2O75334 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPFIA2O75334 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms