Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DYNC1LI2O43237 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms