Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYV3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYV3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYV3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYV3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYV3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYV3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYV3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYV3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYV3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYV3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYV3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYV3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYV3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYV3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYV3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYV3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYV3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYV3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYV3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYV3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYV3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYV3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
V9GYV3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
V9GYV3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
V9GYV3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYV3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYV3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYV3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYV3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYV3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYV3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYV3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYV3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYV3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYV3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
V9GYV3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
V9GYV3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
V9GYV3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
V9GYV3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
V9GYV3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
V9GYV3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
V9GYV3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
V9GYV3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
V9GYV3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
V9GYV3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
V9GYV3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
V9GYV3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
V9GYV3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
V9GYV3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
V9GYV3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
V9GYV3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
V9GYV3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
V9GYV3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
V9GYV3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
V9GYV3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
V9GYV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
V9GYV3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
V9GYV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
V9GYV3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
V9GYV3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
V9GYV3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
V9GYV3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
V9GYV3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
V9GYV3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
V9GYV3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
V9GYV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
V9GYV3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
V9GYV3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
V9GYV3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
V9GYV3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
V9GYV3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
V9GYV3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
V9GYV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
V9GYV3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
V9GYV3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
V9GYV3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
V9GYV3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
V9GYV3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
V9GYV3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
V9GYV3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
V9GYV3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
V9GYV3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
V9GYV3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
V9GYV3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
V9GYV3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
V9GYV3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
V9GYV3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
V9GYV3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
V9GYV3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
V9GYV3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
V9GYV3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
V9GYV3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
V9GYV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
V9GYV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
V9GYV3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
V9GYV3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
V9GYV3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms