Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R4

HEMK1, HemK methyltransferase family member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEMK1Q9Y5R4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HEMK1Q9Y5R4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HEMK1Q9Y5R4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HEMK1Q9Y5R4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HEMK1Q9Y5R4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HEMK1Q9Y5R4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HEMK1Q9Y5R4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HEMK1Q9Y5R4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms