Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCDHB6Q9Y5E3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCDHB6Q9Y5E3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCDHB6Q9Y5E3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCDHB6Q9Y5E3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PCDHB6Q9Y5E3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PCDHB6Q9Y5E3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms