Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXO1Q9UQ84 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXO1Q9UQ84 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXO1Q9UQ84 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXO1Q9UQ84 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXO1Q9UQ84 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EXO1Q9UQ84 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXO1Q9UQ84 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXO1Q9UQ84 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXO1Q9UQ84 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXO1Q9UQ84 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXO1Q9UQ84 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXO1Q9UQ84 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXO1Q9UQ84 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXO1Q9UQ84 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EXO1Q9UQ84 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXO1Q9UQ84 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms