Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDRG4Q9ULP0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDRG4Q9ULP0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDRG4Q9ULP0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDRG4Q9ULP0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDRG4Q9ULP0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms