Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CROTQ9UKG9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CROTQ9UKG9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CROTQ9UKG9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CROTQ9UKG9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms