Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DKK4Q9UBT3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DKK4Q9UBT3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DKK4Q9UBT3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK4Q9UBT3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK4Q9UBT3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK4Q9UBT3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK4Q9UBT3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DKK4Q9UBT3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DKK4Q9UBT3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK4Q9UBT3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DKK4Q9UBT3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DKK4Q9UBT3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DKK4Q9UBT3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DKK4Q9UBT3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DKK4Q9UBT3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DKK4Q9UBT3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DKK4Q9UBT3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DKK4Q9UBT3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms