Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms