Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms