Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.38■■■■■ 5.5
CC2D2AQ9P2K1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC49.35■■■■■ 5.49
CC2D2AQ9P2K1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
CC2D2AQ9P2K1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.32■■■■■ 5.49
CC2D2AQ9P2K1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC49.3■■■■■ 5.48
CC2D2AQ9P2K1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
CC2D2AQ9P2K1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
CC2D2AQ9P2K1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
CC2D2AQ9P2K1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC49.29■■■■■ 5.48
CC2D2AQ9P2K1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.48
CC2D2AQ9P2K1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
CC2D2AQ9P2K1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC49.28■■■■■ 5.48
CC2D2AQ9P2K1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
CC2D2AQ9P2K1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
CC2D2AQ9P2K1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC49.23■■■■■ 5.47
CC2D2AQ9P2K1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
CC2D2AQ9P2K1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
CC2D2AQ9P2K1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC49.21■■■■■ 5.47
CC2D2AQ9P2K1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC49.21■■■■■ 5.47
CC2D2AQ9P2K1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
CC2D2AQ9P2K1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC49.2■■■■■ 5.47
CC2D2AQ9P2K1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
CC2D2AQ9P2K1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
CC2D2AQ9P2K1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.46
CC2D2AQ9P2K1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
CC2D2AQ9P2K1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
CC2D2AQ9P2K1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.17■■■■■ 5.46
CC2D2AQ9P2K1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
CC2D2AQ9P2K1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC49.16■■■■■ 5.46
CC2D2AQ9P2K1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.13■■■■■ 5.46
CC2D2AQ9P2K1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC49.13■■■■■ 5.46
CC2D2AQ9P2K1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
CC2D2AQ9P2K1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.1■■■■■ 5.45
CC2D2AQ9P2K1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.09■■■■■ 5.45
CC2D2AQ9P2K1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
CC2D2AQ9P2K1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
CC2D2AQ9P2K1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
CC2D2AQ9P2K1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
CC2D2AQ9P2K1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC49.05■■■■■ 5.44
CC2D2AQ9P2K1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
CC2D2AQ9P2K1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
CC2D2AQ9P2K1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.02■■■■■ 5.44
CC2D2AQ9P2K1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC49.01■■■■■ 5.44
CC2D2AQ9P2K1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC49.01■■■■■ 5.44
CC2D2AQ9P2K1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC49.01■■■■■ 5.44
CC2D2AQ9P2K1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC49.01■■■■■ 5.44
CC2D2AQ9P2K1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
CC2D2AQ9P2K1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.99■■■■■ 5.43
CC2D2AQ9P2K1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC48.98■■■■■ 5.43
CC2D2AQ9P2K1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
CC2D2AQ9P2K1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
CC2D2AQ9P2K1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
CC2D2AQ9P2K1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC48.95■■■■■ 5.43
CC2D2AQ9P2K1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
CC2D2AQ9P2K1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
CC2D2AQ9P2K1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
CC2D2AQ9P2K1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
CC2D2AQ9P2K1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC48.87■■■■■ 5.41
CC2D2AQ9P2K1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
CC2D2AQ9P2K1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
CC2D2AQ9P2K1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC48.85■■■■■ 5.41
CC2D2AQ9P2K1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
CC2D2AQ9P2K1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC48.83■■■■■ 5.41
CC2D2AQ9P2K1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
CC2D2AQ9P2K1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
CC2D2AQ9P2K1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
CC2D2AQ9P2K1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.79■■■■■ 5.4
CC2D2AQ9P2K1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC48.79■■■■■ 5.4
CC2D2AQ9P2K1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC48.79■■■■■ 5.4
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.78■■■■■ 5.4
CC2D2AQ9P2K1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC48.78■■■■■ 5.4
CC2D2AQ9P2K1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
CC2D2AQ9P2K1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC48.76■■■■■ 5.4
CC2D2AQ9P2K1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
CC2D2AQ9P2K1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
CC2D2AQ9P2K1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC48.73■■■■■ 5.39
CC2D2AQ9P2K1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC48.72■■■■■ 5.39
CC2D2AQ9P2K1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC48.72■■■■■ 5.39
CC2D2AQ9P2K1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.71■■■■■ 5.39
CC2D2AQ9P2K1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC48.7■■■■■ 5.39
CC2D2AQ9P2K1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC48.7■■■■■ 5.39
CC2D2AQ9P2K1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
CC2D2AQ9P2K1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
CC2D2AQ9P2K1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
CC2D2AQ9P2K1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC48.66■■■■■ 5.38
CC2D2AQ9P2K1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
CC2D2AQ9P2K1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
CC2D2AQ9P2K1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
CC2D2AQ9P2K1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
CC2D2AQ9P2K1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
CC2D2AQ9P2K1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC48.59■■■■■ 5.37
CC2D2AQ9P2K1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC48.58■■■■■ 5.37
CC2D2AQ9P2K1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC48.58■■■■■ 5.37
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
CC2D2AQ9P2K1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
CC2D2AQ9P2K1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
CC2D2AQ9P2K1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC48.56■■■■■ 5.36
CC2D2AQ9P2K1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC48.55■■■■■ 5.36
CC2D2AQ9P2K1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.36
CC2D2AQ9P2K1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC48.55■■■■■ 5.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms