Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GSKIPQ9P0R6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GSKIPQ9P0R6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSKIPQ9P0R6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSKIPQ9P0R6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GSKIPQ9P0R6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms