Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0I2

EMC3, ER membrane protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC3Q9P0I2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC3Q9P0I2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMC3Q9P0I2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMC3Q9P0I2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMC3Q9P0I2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms