Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRP1BQ9NZR2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP1BQ9NZR2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP1BQ9NZR2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LRP1BQ9NZR2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LRP1BQ9NZR2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms