Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 KLHDC8B-202ENST00000459846 726 ntTSL 316.55■□□□□ 0.247e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 SUMO3-206ENST00000479153 1736 ntTSL 215.83■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 KLHDC8B-204ENST00000471811 661 ntTSL 215.83■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.47e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 U3.38-201ENST00000408534 216 ntBASIC11.01□□□□□ -0.657e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 RN7SKP93-201ENST00000363838 309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 HSDL1-208ENST00000619773 3059 nt9.45□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.077e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC8.34□□□□□ -1.077e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 UTP18-202ENST00000508506 592 ntTSL 37.01□□□□□ -1.297e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 UTP18-207ENST00000583725 577 ntTSL 34.39□□□□□ -1.717e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 CBFA2T3-203ENST00000562719 539 ntTSL 512.7□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 63.7
AATFQ9NY61 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.32■■□□□ 11e-323■■■■■ 63.5
AATFQ9NY61 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.02■□□□□ 0.961e-323■■■■■ 63.5
AATFQ9NY61 LPIN1-213ENST00000464953 627 ntTSL 318.69■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 63.2
AATFQ9NY61 LPIN1-204ENST00000396099 3228 ntTSL 513.66□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 63.2
AATFQ9NY61 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 63.2
AATFQ9NY61 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 63.2
AATFQ9NY61 LPIN1-205ENST00000404113 4005 ntTSL 1 (best)11.27□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 63.2
AATFQ9NY61 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 63.2
AATFQ9NY61 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 63.2
AATFQ9NY61 LPIN1-210ENST00000454151 583 ntTSL 36.68□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 63.2
AATFQ9NY61 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 63
AATFQ9NY61 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 63
AATFQ9NY61 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 63
AATFQ9NY61 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 63
AATFQ9NY61 TNS1-217ENST00000490566 1652 ntTSL 212.06□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 63
AATFQ9NY61 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 63
AATFQ9NY61 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 63
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AATFQ9NY61 CLASP1-212ENST00000480007 569 ntTSL 410.49□□□□□ -0.731e-10■■■■■ 62.8
AATFQ9NY61 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 510.31□□□□□ -0.761e-10■■■■■ 62.8
AATFQ9NY61 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81e-10■■■■■ 62.8
AATFQ9NY61 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.821e-10■■■■■ 62.8
AATFQ9NY61 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.861e-10■■■■■ 62.8
AATFQ9NY61 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.891e-10■■■■■ 62.8
AATFQ9NY61 CLASP1-211ENST00000474065 516 ntTSL 39.07□□□□□ -0.961e-10■■■■■ 62.8
AATFQ9NY61 CLASP1-205ENST00000430234 582 ntTSL 48.41□□□□□ -1.061e-10■■■■■ 62.8
AATFQ9NY61 CLASP1-204ENST00000418989 663 ntTSL 46.74□□□□□ -1.331e-10■■■■■ 62.8
AATFQ9NY61 CLASP1-206ENST00000449975 555 ntTSL 44.68□□□□□ -1.661e-10■■■■■ 62.8
AATFQ9NY61 APOA2-208ENST00000481413 927 ntTSL 218.91■□□□□ 0.623e-9■■■■■ 62.6
AATFQ9NY61 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 62.6
AATFQ9NY61 APOA2-209ENST00000481511 655 ntTSL 515.37■□□□□ 0.053e-9■■■■■ 62.6
AATFQ9NY61 APOA2-206ENST00000469730 265 ntTSL 513.84□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 62.6
AATFQ9NY61 APOA2-203ENST00000463812 401 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-9■■■■■ 62.6
AATFQ9NY61 APOA2-202ENST00000463273 469 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.653e-9■■■■■ 62.6
AATFQ9NY61 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.433e-9■■■■■ 62.6
AATFQ9NY61 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.513e-9■■■■■ 62.6
AATFQ9NY61 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.883e-9■■■■■ 62.6
AATFQ9NY61 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.953e-9■■■■■ 62.6
AATFQ9NY61 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 62.5
AATFQ9NY61 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 RNH1-217ENST00000529768 1019 ntTSL 227.07■■□□□ 1.922e-7■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 524.95■■□□□ 1.592e-7■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.552e-7■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.472e-7■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 521.96■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 61.8
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AATFQ9NY61 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 61.8
AATFQ9NY61 NUMBL-208ENST00000599594 393 ntTSL 529.46■■■□□ 2.313e-6■■■■■ 61.3
AATFQ9NY61 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 61.3
AATFQ9NY61 NUMBL-204ENST00000595741 559 ntTSL 420.94■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 61.3
AATFQ9NY61 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 61.3
AATFQ9NY61 RPL23A-209ENST00000582736 595 ntTSL 1 (best)17.95■□□□□ 0.461e-323■■■■■ 60.9
AATFQ9NY61 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.541e-323■■■■■ 60.9
AATFQ9NY61 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 60.8
AATFQ9NY61 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 60.8
AATFQ9NY61 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 60.8
AATFQ9NY61 PDE4A-208ENST00000591971 836 ntTSL 515.27■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 60.8
AATFQ9NY61 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 60.8
AATFQ9NY61 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.213e-11■■■■■ 60.7
AATFQ9NY61 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 60.6
AATFQ9NY61 C12orf57-203ENST00000538392 979 ntTSL 223.03■■□□□ 1.283e-11■■■■■ 59.3
AATFQ9NY61 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.493e-11■■■■■ 59.3
AATFQ9NY61 PTS-209ENST00000531673 986 ntTSL 1 (best)16.9■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 59.3
AATFQ9NY61 C12orf57-202ENST00000537087 662 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.243e-11■■■■■ 59.3
AATFQ9NY61 C12orf57-207ENST00000545581 556 ntTSL 311.45□□□□□ -0.583e-11■■■■■ 59.3
AATFQ9NY61 C12orf57-205ENST00000542222 640 ntTSL 211.23□□□□□ -0.613e-11■■■■■ 59.3
AATFQ9NY61 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 515.45■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 59.1
AATFQ9NY61 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 319.3■□□□□ 0.688e-7■■■■■ 59
AATFQ9NY61 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.99e-8■■■■■ 59
AATFQ9NY61 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 326.33■■□□□ 1.819e-8■■■■■ 59
AATFQ9NY61 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 320.18■□□□□ 0.829e-8■■■■■ 59
AATFQ9NY61 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 218.19■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 58.6
AATFQ9NY61 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 58.6
AATFQ9NY61 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 319.64■□□□□ 0.734e-8■■■■■ 58.5
AATFQ9NY61 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 58.4
AATFQ9NY61 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.149e-16■■■■■ 58.3
AATFQ9NY61 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.059e-16■■■■■ 58.3
AATFQ9NY61 RC3H2-210ENST00000498479 5746 ntTSL 213.18□□□□□ -0.39e-16■■■■■ 58.3
AATFQ9NY61 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.329e-16■■■■■ 58.3
AATFQ9NY61 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.659e-16■■■■■ 58.3
AATFQ9NY61 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.579e-16■■■■■ 58.3
AATFQ9NY61 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 58
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