Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ING3Q9NXR8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ING3Q9NXR8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ING3Q9NXR8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ING3Q9NXR8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ING3Q9NXR8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms