Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVK13-1Q9NX77 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVK13-1Q9NX77 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK13-1Q9NX77 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVK13-1Q9NX77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK13-1Q9NX77 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVK13-1Q9NX77 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms