Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB1

RBFOX1, RNA binding protein fox-1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX1Q9NWB1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBFOX1Q9NWB1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBFOX1Q9NWB1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBFOX1Q9NWB1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBFOX1Q9NWB1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBFOX1Q9NWB1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms