Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCLQ9NW38 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FANCLQ9NW38 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FANCLQ9NW38 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FANCLQ9NW38 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCLQ9NW38 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FANCLQ9NW38 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCLQ9NW38 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCLQ9NW38 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FANCLQ9NW38 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FANCLQ9NW38 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCLQ9NW38 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FANCLQ9NW38 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FANCLQ9NW38 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCLQ9NW38 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCLQ9NW38 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCLQ9NW38 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FANCLQ9NW38 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FANCLQ9NW38 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCLQ9NW38 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FANCLQ9NW38 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FANCLQ9NW38 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FANCLQ9NW38 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCLQ9NW38 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCLQ9NW38 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCLQ9NW38 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCLQ9NW38 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCLQ9NW38 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCLQ9NW38 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCLQ9NW38 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCLQ9NW38 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCLQ9NW38 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FANCLQ9NW38 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FANCLQ9NW38 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FANCLQ9NW38 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCLQ9NW38 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms