Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD18Q9NS91 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD18Q9NS91 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD18Q9NS91 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD18Q9NS91 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAD18Q9NS91 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAD18Q9NS91 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAD18Q9NS91 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD18Q9NS91 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD18Q9NS91 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD18Q9NS91 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD18Q9NS91 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms