Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.97e-9■■■■■ 63.8
DROSHAQ9NRR4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.847e-9■■■■■ 63.8
DROSHAQ9NRR4 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.797e-9■■■■■ 63.8
DROSHAQ9NRR4 ITGB2-217ENST00000521987 563 ntTSL 419.78■□□□□ 0.767e-9■■■■■ 63.8
DROSHAQ9NRR4 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.637e-9■■■■■ 63.8
DROSHAQ9NRR4 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.567e-9■■■■■ 63.8
DROSHAQ9NRR4 ITGB2-212ENST00000498666 4781 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.37e-9■■■■■ 63.8
DROSHAQ9NRR4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.336e-8■■■■■ 63.3
DROSHAQ9NRR4 NINJ2-204ENST00000537416 323 ntTSL 321.09■□□□□ 0.976e-8■■■■■ 63.3
DROSHAQ9NRR4 NINJ2-203ENST00000433832 945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.046e-8■■■■■ 63.3
DROSHAQ9NRR4 NINJ2-205ENST00000542920 670 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.066e-8■■■■■ 63.3
DROSHAQ9NRR4 NINJ2-202ENST00000397265 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 63.3
DROSHAQ9NRR4 NFYC-221ENST00000525349 582 ntTSL 315.64■□□□□ 0.091e-9■■■■■ 62.9
DROSHAQ9NRR4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.073e-13■■■■■ 62.4
DROSHAQ9NRR4 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-13■■■■■ 62.4
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-209ENST00000434163 534 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.026e-7■■■■■ 62.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-209ENST00000488627 1118 ntTSL 324.5■■□□□ 1.517e-9■■■■■ 61
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-206ENST00000464255 926 ntTSL 520.27■□□□□ 0.847e-9■■■■■ 61
DROSHAQ9NRR4 TRMT2A-210ENST00000464535 943 ntTSL 230.67■■■□□ 2.54e-12■■■■■ 60.3
DROSHAQ9NRR4 TRMT2A-207ENST00000445045 582 ntTSL 428.84■■■□□ 2.214e-12■■■■■ 60.3
DROSHAQ9NRR4 TRMT2A-219ENST00000494641 1060 ntTSL 328.07■■■□□ 2.084e-12■■■■■ 60.3
DROSHAQ9NRR4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.94■■■■■ 4.622e-12■■■■■ 59.6
DROSHAQ9NRR4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.061e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.681e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.321e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 NEK6-209ENST00000444973 790 ntTSL 544.62■■■■■ 4.731e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 NEK6-211ENST00000454453 732 ntTSL 341.1■■■■■ 4.171e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 31e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.71e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.61e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 AP006621.3-201ENST00000526588 291 ntTSL 231.13■■■□□ 2.572e-14■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 TXNDC17-207ENST00000574734 616 ntTSL 330.56■■■□□ 2.481e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.41e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 21e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.791e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.681e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 CHFR-214ENST00000536932 584 ntTSL 424.16■■□□□ 1.462e-9■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF605-201ENST00000331711 838 ntTSL 224.16■■□□□ 1.462e-9■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 LPIN1-213ENST00000464953 627 ntTSL 323.56■■□□□ 1.361e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 TXNDC17-206ENST00000574429 2100 nt22.78■■□□□ 1.241e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.211e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 OSBPL3-210ENST00000415952 568 ntTSL 422.42■■□□□ 1.181e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 TXNDC17-204ENST00000571957 392 ntTSL 221.13■□□□□ 0.971e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 SLC19A1-206ENST00000460174 600 ntTSL 321.06■□□□□ 0.961e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 NEK6-202ENST00000373596 758 ntTSL 320.8■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 RNF121-207ENST00000526549 2375 ntTSL 220.51■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC19.98■□□□□ 0.792e-11■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 IQSEC2-214ENST00000639796 2351 ntTSL 319.08■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 TXNDC17-209ENST00000576020 391 ntTSL 218.12■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 IQSEC2-215ENST00000640005 1323 ntTSL 417.66■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 NEK6-208ENST00000425237 806 ntTSL 317.6■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 AL162724.1-201ENST00000437461 373 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 LPIN1-204ENST00000396099 3228 ntTSL 517.14■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 NEK6-201ENST00000320246 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 GNAS-AS1-204ENST00000631314 462 ntTSL 515.54■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF605-203ENST00000381215 1143 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 IQSEC2-206ENST00000638521 4501 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.36□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 LPIN1-205ENST00000404113 4005 ntTSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 IQSEC2-201ENST00000375365 4004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 CCND2-201ENST00000261254 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 IQSEC2-209ENST00000638869 3000 ntTSL 513.19□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF605-205ENST00000412621 541 ntTSL 410□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 LPIN1-210ENST00000454151 583 ntTSL 38.37□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.641e-7■■■■■ 59.4
DROSHAQ9NRR4 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.098e-9■■■■■ 59
DROSHAQ9NRR4 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 57.9
DROSHAQ9NRR4 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.051e-16■■■■■ 57.9
DROSHAQ9NRR4 TMEM245-202ENST00000413712 1973 ntTSL 212.08□□□□□ -0.481e-16■■■■■ 57.9
DROSHAQ9NRR4 TMEM245-205ENST00000491854 2435 ntTSL 210.36□□□□□ -0.751e-16■■■■■ 57.9
DROSHAQ9NRR4 AMDHD2-212ENST00000566706 940 ntTSL 534.64■■■■□ 3.142e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 AMDHD2-211ENST00000565963 844 ntTSL 532.01■■■□□ 2.712e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 AMDHD2-214ENST00000567475 714 ntTSL 231.59■■■□□ 2.652e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 AMDHD2-209ENST00000563633 1117 ntTSL 531.14■■■□□ 2.582e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 AMDHD2-217ENST00000569879 924 ntTSL 330.67■■■□□ 2.52e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 AMDHD2-208ENST00000563556 490 ntTSL 430.67■■■□□ 2.52e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.322e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 AMDHD2-215ENST00000568263 1482 ntTSL 227.69■■■□□ 2.022e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.022e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 AMDHD2-216ENST00000569219 735 ntTSL 227.08■■□□□ 1.932e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.752e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 CDK1-203ENST00000395284 1913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 CDK1-205ENST00000475504 1720 ntTSL 211.09□□□□□ -0.632e-11■■■■■ 57.6
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