Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD90

NEUROD4, Neurogenic differentiation factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD4Q9HD90 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD4Q9HD90 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD4Q9HD90 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD4Q9HD90 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEUROD4Q9HD90 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD4Q9HD90 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEUROD4Q9HD90 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD4Q9HD90 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD4Q9HD90 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD4Q9HD90 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD4Q9HD90 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD4Q9HD90 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEUROD4Q9HD90 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD4Q9HD90 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD4Q9HD90 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD4Q9HD90 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEUROD4Q9HD90 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD4Q9HD90 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms