Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A9

PCNX3, Pecanex-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3Q9H6A9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX3Q9H6A9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX3Q9H6A9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCNX3Q9H6A9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCNX3Q9H6A9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCNX3Q9H6A9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNX3Q9H6A9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms