Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5U6

ZCCHC4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC4Q9H5U6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC4Q9H5U6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC4Q9H5U6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC4Q9H5U6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC4Q9H5U6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC4Q9H5U6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC4Q9H5U6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms