Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MIXL1Q9H2W2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIXL1Q9H2W2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIXL1Q9H2W2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIXL1Q9H2W2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIXL1Q9H2W2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms