Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF39Q9H2S5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF39Q9H2S5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF39Q9H2S5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF39Q9H2S5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF39Q9H2S5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF39Q9H2S5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF39Q9H2S5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF39Q9H2S5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF39Q9H2S5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF39Q9H2S5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF39Q9H2S5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF39Q9H2S5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF39Q9H2S5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF39Q9H2S5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF39Q9H2S5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF39Q9H2S5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF39Q9H2S5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF39Q9H2S5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF39Q9H2S5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF39Q9H2S5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF39Q9H2S5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF39Q9H2S5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF39Q9H2S5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF39Q9H2S5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF39Q9H2S5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms