Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1K6

TLNRD1, Talin rod domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLNRD1Q9H1K6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLNRD1Q9H1K6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLNRD1Q9H1K6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TLNRD1Q9H1K6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLNRD1Q9H1K6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms