Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHARPINQ9H0F6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHARPINQ9H0F6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHARPINQ9H0F6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHARPINQ9H0F6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHARPINQ9H0F6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms