Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC90BQ9GZT6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC90BQ9GZT6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC90BQ9GZT6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC90BQ9GZT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC90BQ9GZT6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC90BQ9GZT6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC90BQ9GZT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC90BQ9GZT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC90BQ9GZT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC90BQ9GZT6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC90BQ9GZT6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC90BQ9GZT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC90BQ9GZT6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms