Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF518BQ9C0D4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF518BQ9C0D4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF518BQ9C0D4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF518BQ9C0D4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF518BQ9C0D4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF518BQ9C0D4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF518BQ9C0D4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms