Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM31Q9BZY9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM31Q9BZY9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM31Q9BZY9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM31Q9BZY9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM31Q9BZY9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM31Q9BZY9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms