Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM79Q9BSE2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM79Q9BSE2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TMEM79Q9BSE2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM79Q9BSE2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM79Q9BSE2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms