Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3GL1Q99961 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3GL1Q99961 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3GL1Q99961 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3GL1Q99961 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3GL1Q99961 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3GL1Q99961 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3GL1Q99961 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3GL1Q99961 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3GL1Q99961 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3GL1Q99961 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3GL1Q99961 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3GL1Q99961 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3GL1Q99961 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GL1Q99961 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms