Protein–RNA interactions for Protein: Q99808

SLC29A1, Equilibrative nucleoside transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A1Q99808 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC29A1Q99808 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC29A1Q99808 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC29A1Q99808 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC29A1Q99808 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC29A1Q99808 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC29A1Q99808 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC29A1Q99808 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC29A1Q99808 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC29A1Q99808 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC29A1Q99808 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC29A1Q99808 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC29A1Q99808 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms