Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ARAP1Q96P48 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
ARAP1Q96P48 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
ARAP1Q96P48 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
ARAP1Q96P48 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
ARAP1Q96P48 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
ARAP1Q96P48 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ARAP1Q96P48 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
ARAP1Q96P48 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ARAP1Q96P48 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
ARAP1Q96P48 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC43.75■■■■■ 4.59
ARAP1Q96P48 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
ARAP1Q96P48 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
ARAP1Q96P48 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ARAP1Q96P48 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
ARAP1Q96P48 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
ARAP1Q96P48 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
ARAP1Q96P48 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
ARAP1Q96P48 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
ARAP1Q96P48 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
ARAP1Q96P48 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ARAP1Q96P48 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ARAP1Q96P48 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC43.63■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC43.61■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
ARAP1Q96P48 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
ARAP1Q96P48 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
ARAP1Q96P48 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
ARAP1Q96P48 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
ARAP1Q96P48 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ARAP1Q96P48 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ARAP1Q96P48 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
ARAP1Q96P48 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC43.51■■■■■ 4.56
ARAP1Q96P48 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
ARAP1Q96P48 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.51■■■■■ 4.56
ARAP1Q96P48 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ARAP1Q96P48 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
ARAP1Q96P48 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
ARAP1Q96P48 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
ARAP1Q96P48 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ARAP1Q96P48 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
ARAP1Q96P48 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ARAP1Q96P48 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ARAP1Q96P48 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
ARAP1Q96P48 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ARAP1Q96P48 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
ARAP1Q96P48 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
ARAP1Q96P48 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ARAP1Q96P48 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ARAP1Q96P48 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ARAP1Q96P48 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ARAP1Q96P48 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
ARAP1Q96P48 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
ARAP1Q96P48 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
ARAP1Q96P48 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
ARAP1Q96P48 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
ARAP1Q96P48 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ARAP1Q96P48 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ARAP1Q96P48 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
ARAP1Q96P48 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
ARAP1Q96P48 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
ARAP1Q96P48 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ARAP1Q96P48 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
ARAP1Q96P48 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
ARAP1Q96P48 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
ARAP1Q96P48 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms