Protein–RNA interactions for Protein: Q96MZ0

GDAP1L1, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP1L1Q96MZ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GDAP1L1Q96MZ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDAP1L1Q96MZ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDAP1L1Q96MZ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDAP1L1Q96MZ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDAP1L1Q96MZ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDAP1L1Q96MZ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDAP1L1Q96MZ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDAP1L1Q96MZ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDAP1L1Q96MZ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDAP1L1Q96MZ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDAP1L1Q96MZ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDAP1L1Q96MZ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDAP1L1Q96MZ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDAP1L1Q96MZ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDAP1L1Q96MZ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDAP1L1Q96MZ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDAP1L1Q96MZ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDAP1L1Q96MZ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDAP1L1Q96MZ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDAP1L1Q96MZ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDAP1L1Q96MZ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDAP1L1Q96MZ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDAP1L1Q96MZ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDAP1L1Q96MZ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms