Protein–RNA interactions for Protein: Q96H78

SLC25A44, Solute carrier family 25 member 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A44Q96H78 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A44Q96H78 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A44Q96H78 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A44Q96H78 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A44Q96H78 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A44Q96H78 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A44Q96H78 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A44Q96H78 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A44Q96H78 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A44Q96H78 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A44Q96H78 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A44Q96H78 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A44Q96H78 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A44Q96H78 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A44Q96H78 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A44Q96H78 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A44Q96H78 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A44Q96H78 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A44Q96H78 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A44Q96H78 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms