Protein–RNA interactions for Protein: Q96G97

BSCL2, Seipin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSCL2Q96G97 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BSCL2Q96G97 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BSCL2Q96G97 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BSCL2Q96G97 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BSCL2Q96G97 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BSCL2Q96G97 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms