Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MED8Q96G25 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MED8Q96G25 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED8Q96G25 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MED8Q96G25 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms