Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO17Q96EF6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO17Q96EF6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO17Q96EF6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO17Q96EF6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO17Q96EF6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms