Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YIPF6Q96EC8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF6Q96EC8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF6Q96EC8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YIPF6Q96EC8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YIPF6Q96EC8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF6Q96EC8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIPF6Q96EC8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms