Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP4Q96DX8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP4Q96DX8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RTP4Q96DX8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTP4Q96DX8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTP4Q96DX8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP4Q96DX8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP4Q96DX8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP4Q96DX8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP4Q96DX8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP4Q96DX8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP4Q96DX8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP4Q96DX8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP4Q96DX8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP4Q96DX8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTP4Q96DX8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP4Q96DX8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP4Q96DX8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms