Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTHRC1Q96CG8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTHRC1Q96CG8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTHRC1Q96CG8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTHRC1Q96CG8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTHRC1Q96CG8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTHRC1Q96CG8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CTHRC1Q96CG8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTHRC1Q96CG8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTHRC1Q96CG8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms