Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPTQ96BT3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPTQ96BT3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPTQ96BT3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPTQ96BT3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPTQ96BT3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPTQ96BT3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPTQ96BT3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms