Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNPO1Q92973 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNPO1Q92973 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNPO1Q92973 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNPO1Q92973 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNPO1Q92973 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNPO1Q92973 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNPO1Q92973 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNPO1Q92973 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNPO1Q92973 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNPO1Q92973 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNPO1Q92973 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNPO1Q92973 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNPO1Q92973 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNPO1Q92973 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNPO1Q92973 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNPO1Q92973 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNPO1Q92973 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNPO1Q92973 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TNPO1Q92973 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
TNPO1Q92973 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNPO1Q92973 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TNPO1Q92973 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNPO1Q92973 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNPO1Q92973 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNPO1Q92973 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms