Protein–RNA interactions for Protein: Q92766

RREB1, Ras-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RREB1Q92766 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RREB1Q92766 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RREB1Q92766 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RREB1Q92766 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RREB1Q92766 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RREB1Q92766 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RREB1Q92766 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RREB1Q92766 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
RREB1Q92766 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RREB1Q92766 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
RREB1Q92766 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
RREB1Q92766 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RREB1Q92766 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RREB1Q92766 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RREB1Q92766 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RREB1Q92766 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RREB1Q92766 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
RREB1Q92766 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
RREB1Q92766 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RREB1Q92766 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
RREB1Q92766 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RREB1Q92766 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RREB1Q92766 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RREB1Q92766 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RREB1Q92766 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RREB1Q92766 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RREB1Q92766 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RREB1Q92766 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RREB1Q92766 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RREB1Q92766 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RREB1Q92766 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RREB1Q92766 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RREB1Q92766 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RREB1Q92766 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RREB1Q92766 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RREB1Q92766 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RREB1Q92766 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RREB1Q92766 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
RREB1Q92766 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RREB1Q92766 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RREB1Q92766 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RREB1Q92766 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RREB1Q92766 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RREB1Q92766 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
RREB1Q92766 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
RREB1Q92766 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RREB1Q92766 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RREB1Q92766 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RREB1Q92766 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RREB1Q92766 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
RREB1Q92766 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RREB1Q92766 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RREB1Q92766 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RREB1Q92766 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RREB1Q92766 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RREB1Q92766 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RREB1Q92766 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RREB1Q92766 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RREB1Q92766 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RREB1Q92766 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RREB1Q92766 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RREB1Q92766 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RREB1Q92766 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RREB1Q92766 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RREB1Q92766 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms