Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRK1Q8WUW1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRK1Q8WUW1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRK1Q8WUW1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BRK1Q8WUW1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRK1Q8WUW1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRK1Q8WUW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRK1Q8WUW1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRK1Q8WUW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRK1Q8WUW1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRK1Q8WUW1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BRK1Q8WUW1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRK1Q8WUW1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRK1Q8WUW1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRK1Q8WUW1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms