Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R17PQ8TDU5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VN1R17PQ8TDU5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R17PQ8TDU5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R17PQ8TDU5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms